GC-innhold-kalkulator

Finn GC-innholdet og basesammensetningen i en nukleotidsekvens.

Slik bruker du den

  1. Skriv inn de nødvendige verdiene i feltene.
  2. Klikk på «Beregn» for å se resultatet.
  3. Kopier eller del resultatet med «Del»-knappen.

Om denne kalkulatoren

Denne kalkulatoren finner GC-innholdet i en DNA- eller RNA-sekvens — prosentandelen baser som er guanin (G) eller cytosin (C) i stedet for adenin (A) og tymin/uracil (T/U): GC% = (G+C) / totalt antall baser × 100. Siden G parrer seg med C via tre hydrogenbindinger (mot to for A-T), betyr høyere GC-innhold generelt en termisk mer stabil dobbelheliks med høyere smeltetemperatur.

Molekylærbiologer bruker GC-innhold til å designe PCR-primere, anslå annealingstemperaturen for labprotokoller, vurdere genomsammensetning mellom arter, og flagge potensielle problemer med sekvensering eller sammenstilling, siden ekstremt GC-innhold (svært høyt eller svært lavt) er vanskeligere å sekvensere nøyaktig. Lim inn en DNA- eller RNA-sekvens for å få GC-prosenten og en fullstendig oversikt over basesammensetningen.

Was this helpful?

Du kan velge opptil 3 reaksjoner.

Comments

  • Be the first to comment.

Populære kalkulatorer

Alle kalkulatorer