GC-pitoisuuden laskuri

Selvitä nukleotidisekvenssin GC-pitoisuus ja emäskoostumus.

Käyttöohjeet

  1. Syötä arvosi yllä oleviin kenttiin.
  2. Näe tulos painamalla "Laske".
  3. Lähetä tuloksesi "Jaa"-painikkeella.

Tietoa tästä laskurista

Tämä laskuri laskee DNA- tai RNA-sekvenssin GC-pitoisuuden — emästen prosenttiosuuden, jotka ovat guaniinia (G) tai sytosiinia (C) adeniinin (A) ja tymiinin/urasiilin (T/U) sijaan: GC% = (G+C) / emäkset yhteensä × 100. Koska G pariutuu C:n kanssa kolmen vetysidoksen avulla (kun A-T-parilla on kaksi), korkeampi GC-pitoisuus tarkoittaa yleensä termisesti vakaampaa kaksoiskierrettä ja korkeampaa sulamislämpötilaa.

Molekyylibiologit käyttävät GC-pitoisuutta PCR-alukkeiden suunnitteluun, laboratorioprotokollien pariutumislämpötilan arvioimiseen, genomin koostumuksen arvioimiseen eri lajien välillä ja mahdollisten sekvensointi- tai koontivirheiden havaitsemiseen, koska äärimmäistä GC-pitoisuutta (erittäin korkeaa tai matalaa) on vaikeampi sekvensoida tarkasti. Liitä DNA- tai RNA-sekvenssi saadaksesi sen GC-prosenttiosuuden ja koko emäskoostumuksen erittelyn.

Was this helpful?

Voit valita enintään 3 reaktiota.

Comments

  • Be the first to comment.

Suositut laskimet

Kaikki laskurit