ماشین‌حساب محتوای GC

درباره این ابزار

این ماشین‌حساب محتوای GC یک توالی DNA یا RNA را می‌یابد — درصد بازهایی که گوانین (G) یا سیتوزین (C) هستند به‌جای آدنین (A) و تیمین/اوراسیل (T/U): GC% = (G+C) / کل بازها × 100. چون G از طریق سه پیوند هیدروژنی با C جفت می‌شود (در مقابل دو پیوند برای A-T)، محتوای GC بالاتر عموماً به معنای مارپیچ دوگانه‌ای پایدارتر از نظر گرمایی با دمای ذوب بالاتر است.

زیست‌شناسان مولکولی از محتوای GC برای طراحی پرایمرهای PCR، برآورد دمای اتصال برای پروتکل‌های آزمایشگاهی، ارزیابی ترکیب ژنوم در گونه‌های مختلف، و شناسایی مشکلات احتمالی توالی‌یابی یا سرهم‌بندی استفاده می‌کنند، زیرا محتوای GC حدی (بسیار بالا یا بسیار پایین) توالی‌یابی دقیق را دشوارتر می‌کند. یک توالی DNA یا RNA را بچسبانید تا درصد GC و تفکیک کامل ترکیب بازها به دست آید.