GC含量計算ツール
ヌクレオチド配列のGC含量と塩基組成を求めます。
結果
使い方
- 上のフィールドに値を入力します。
- 「計算」を押すと結果がすぐに表示されます。
- 「共有」ボタンで結果へのリンクをコピーできます。
この計算ツールについて
このツールは、DNAまたはRNA配列のGC含量――アデニン(A)とチミン/ウラシル(T/U)ではなく、グアニン(G)またはシトシン(C)である塩基の割合――を求めます:GC% = (G+C) / 全塩基数 × 100。GはCと3本の水素結合で対を作るため(A-Tは2本)、GC含量が高いほど、一般に二重らせんは熱的に安定し、融解温度も高くなります。
分子生物学者は、GC含量を使ってPCRプライマーを設計し、実験プロトコルのアニーリング温度を推定し、種ごとのゲノム構成を評価し、極端なGC含量(非常に高いまたは非常に低い)は正確な配列決定が難しくなるため、配列決定やアセンブリの潜在的な問題を見つけます。DNAまたはRNA配列を貼り付けると、GC含量のパーセンテージと塩基組成の全体の内訳が得られます。
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