Υπολογιστής περιεκτικότητας GC

Σχετικά με αυτόν τον υπολογιστή

Αυτός ο υπολογιστής βρίσκει την περιεκτικότητα GC μιας αλληλουχίας DNA ή RNA — το ποσοστό των βάσεων που είναι γουανίνη (G) ή κυτοσίνη (C) και όχι αδενίνη (A) και θυμίνη/ουρακίλη (T/U): GC% = (G+C) / συνολικές βάσεις × 100. Επειδή η G συζευγνύεται με τη C μέσω τριών δεσμών υδρογόνου (έναντι δύο για το A-T), υψηλότερη περιεκτικότητα GC σημαίνει γενικά μια θερμικά πιο σταθερή διπλή έλικα με υψηλότερη θερμοκρασία τήξης.

Μοριακοί βιολόγοι χρησιμοποιούν την περιεκτικότητα GC για να σχεδιάσουν εκκινητές PCR, να εκτιμήσουν τη θερμοκρασία υβριδισμού για εργαστηριακά πρωτόκολλα, να αξιολογήσουν τη σύσταση του γονιδιώματος σε διάφορα είδη, και να επισημάνουν πιθανά προβλήματα αλληλούχισης ή συναρμολόγησης, καθώς μια ακραία περιεκτικότητα GC (πολύ υψηλή ή πολύ χαμηλή) είναι δυσκολότερο να αλληλουχηθεί με ακρίβεια. Επικολλήστε μια αλληλουχία DNA ή RNA για να λάβετε το ποσοστό GC της και την πλήρη ανάλυση σύστασης βάσεων.