เครื่องคำนวณปริมาณ GC

เกี่ยวกับเครื่องคำนวณนี้

เครื่องคำนวณนี้หาปริมาณ GC ของลำดับดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอ — เปอร์เซ็นต์ของเบสที่เป็นกัวนีน (G) หรือไซโตซีน (C) แทนที่จะเป็นอะดีนีนและไทมีน/ยูราซิล (A และ T/U): GC% = (G+C) / เบสทั้งหมด × 100 เนื่องจาก G จับคู่กับ C ผ่านพันธะไฮโดรเจนสามพันธะ (เทียบกับสองพันธะสำหรับ A-T) ปริมาณ GC ที่สูงกว่าจึงมักหมายถึงเกลียวคู่ที่มีความเสถียรทางความร้อนมากกว่าและมีอุณหภูมิหลอมเหลวสูงกว่า

นักชีววิทยาระดับโมเลกุลใช้ปริมาณ GC ในการออกแบบไพรเมอร์ PCR ประมาณอุณหภูมิการจับคู่สำหรับโพรโทคอลในแล็บ ประเมินองค์ประกอบจีโนมข้ามสปีชีส์ และชี้ปัญหาที่อาจเกิดในการหาลำดับหรือการประกอบลำดับ เนื่องจากปริมาณ GC ที่สุดขั้ว (สูงมากหรือต่ำมาก) หาลำดับได้ยากกว่าให้แม่นยำ วางลำดับดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอเพื่อได้เปอร์เซ็นต์ GC และรายละเอียดองค์ประกอบเบสแบบเต็ม