Máy tính hàm lượng GC

Giới thiệu về công cụ này

Máy tính này tìm hàm lượng GC của một chuỗi ADN hoặc ARN — tỷ lệ phần trăm các base là guanin (G) hoặc cytosin (C) thay vì adenin (A) và thymin/uracil (T/U): GC% = (G+C) / tổng số base × 100. Vì G liên kết với C qua ba liên kết hydro (so với hai liên kết của A-T), hàm lượng GC cao hơn thường có nghĩa là chuỗi xoắn kép ổn định nhiệt hơn với nhiệt độ nóng chảy cao hơn.

Các nhà sinh học phân tử dùng hàm lượng GC để thiết kế mồi PCR, ước tính nhiệt độ bắt cặp cho các quy trình trong phòng thí nghiệm, đánh giá thành phần bộ gen giữa các loài, và phát hiện các vấn đề tiềm ẩn về giải trình tự hoặc lắp ráp, vì hàm lượng GC cực đoan (rất cao hoặc rất thấp) khó giải trình tự chính xác hơn. Dán một chuỗi ADN hoặc ARN để nhận tỷ lệ phần trăm GC và phân tích đầy đủ thành phần base.